İhraç edilen bitki ve bitkisel ürünlerin alıcı ülke Zirai Karantina Şartlarına göre kontrollerini yapmak, hastalık ve zararlılardan arındırılmış olarak gönderilmesini sağlamak,

İthal edilen bitki ve bitkisel ürünlerin Ülkemiz Zirai Karantina Şartlarına göre kontrollerini yaparak,

Dış karantinaya tabi organizmaların yurda girişine engel olmak,

İthali yasak olan bitki ve bitkisel ürünlerin yurda girişine engel olmak,

İthal ve ihraç edilen Zirai Mücadele ilaçlarının kontrollerini yapmak,

İthal ve ihraç edilen bitkisel ürünlerin ve depolarının gerektiğinde fümigasyon ve dezenfeksiyonunu yapmak veya yaptırmak.

Ayrıca Müdürlüğümüz, Bakanlığımızın görevlendirmesi ile İnspektörlük, Fümigasyon Operatörü ve Fumigasyon operatörü yardımcısı kursları düzenlemek.