Ülkemizde bulunmayan veya çok mahdut bir alanda görülen bitkisel hastalık ve zararlıların, konukçularının ve ithali yasak edilmiş olan bitkisel materyallerin ülkemize, girişini önlemek.
Dış ülkelere ihraç edilecek bitki ve bitkisel ürünlerin; alıcı ve transit geçecek Ülkelerin zirai karantina şartlarına uygun olarak kontrollerini tamamlamak ve sertifikalandırmak.
İthal ve ihraç olunan zirai mücadele ilaç ve aletlerinin gerekli kontrollerini yaparak vize işlemlerini gerçekleştirmek.
İhraç ve ithal edilen bitki ve bitkisel ürünlerin depolandığı nakledildiği depo ve ulaşım araçlarının kontrolünü ve gerektiği hallerde fümigasyon ve dezenfeksiyon işlemlerini yapmak veya yaptırmak.
Karantinaya tabi hastalık ve zararlıların keşif ve sınırlandırma sürveylerini zamanında bitirmek.