6968 sayılı Zirai Mücadele ve Zirai Karantina Kanunu çerçevesinde ülkemize giriş yapan her türlü bitkisel materyaller, laboratuarımızda Zirai Karantina Yönetmeliğinde yer alan bakteriyel hastalık etmenleri yönünden analize alınmaktadır. Bakteriyel hastalık etmenlerinin tespitinde patojenisite testleri, tütünde aşırı duyarlılık reaksiyonu, biyokimyasal testler (KOH testi, Oksidaz Testi, Aseton Testi, İndol üretim Testi vb…) ve serolojik tanı yöntemleri kullanılmaktadır. Yapılan analizler sonucunda, gerekli görüldüğü takdirde moleküler yöntemler kullanılarak da analiz tekrarlanmaktadır. Bölümümüzde 2 uzman personel görev yapmaktadır.​