İzmir Zirai Karantina Müdürlüğü ilk olarak 1 Mart 1950′de İzmir Bornova Zirai Mücadele Araştırma Enstitüsünde Zirai Karantina Laboratuar Şefliği adı altında görevine başlamıştır. 15 Mayıs 1957′de kabul edilen 6968 Sayılı Zirai Mücadele ve Zirai Karantina Kanununa göre Zirai Karantina ve Fümigatuvar Müdürlüğüadını alarak Tarım Bakanlığı’na bağlı müstakil bir kuruluş haline gelmiştir.
1 Mart 1966 tarihinde Bakanlığımız, Kurumumuzun bölge çapında hizmet görmesini uygun bularak görev sınırlarını kuzeyde Bandırma’dan, güneyde Fethiye’ye kadar genişletmiş ve adını Bölge Zirai Karantina Müdürlüğü olarak değiştirmiştir. 1968′de kurumumuz bünyesinde Döner Sermaye İşletmesi kurulmuş ve hizmetlerin daha etkin bir şekilde yürütülmesi sağlanmıştır. 1985 yılında yapılan reorganizasyon ile diğer Tarım Kuruluşları gibi Müdürlüğümüz de lağvedilerek yeni kurulan Tarım İl Müdürlüğü bünyesine alınmıştır. Dokuz ay gibi kısa bir süre sonra Müdürlüğümüzün işlerinin çok yoğun olması ve görevinin özellik arz etmesi dolayısıyla İl Müdürlüğü bünyesinden alınarak İl Müdürlüğüne bağlı Müdürlük olarak faaliyetlerine devam etmiştir. 1990 yılında yapılan Alsancak’taki kendi binasına taşınmış, halen bu binada çalışmalarına devam etmektedir.
1996 yılından 2000 yılına kadar Tarım ve Köyişleri Bakanlığına doğrudan bağlı olarak faaliyetlerini sürdüren Müdürlüğümüz, 2000-2008 yılları arasında İzmir Tarım İl Müdürlüğüne bağlı olarak ve 2008 yılından itibaren yine doğrudan Bakanlığa bağlı kuruluş olarak hizmet vermeye devam etmiştir. 2005 yılında bünyesinde bir Laboratuvar kuruluşunu tamamlayarak alanında uzman personeliyle hizmet veren Müdürlüğümüzün Gıda Tarım ve Hayvancılık Bakanlığı kuruluş kanunu ile birlikte yapısında ve isminde herhangi bir değişiklik yapılmamıştır.
Misyonumuz
Etkin kontroller yaparak bitki sağlığını tehdit eden zararlı organizmaların ülkemize bulaşmasını ve yayılmasını önlemek; kaliteli, adil, kolay erişilebilir, insan odaklı hizmet veren ve mali açıdan sürdürülebilir bir Zirai Karantina sistemini yürütmek ve geliştirmektir.
