Serbest Bölgelerden ihraç edilmek amacıyla düzenlenen BSS'ler için TPS ID numarası alan firmalar, ihracat aşamasında ihracat beyanname TPS ID'yi beyan edememekte; bu nedenle, Serbest Bölgelerden transit beyannameleri ile ihraç edilen ürünlerin BSS'lerinin QR kodu okutulduğunda, ürünlerin yurtdışına çıkış yapıp yapmadığı bilgisi görüntülenememekteydi. Bu duruma ilişkin olarak, Gümrükler Genel Müdürlüğü'nün Transit Programı (NCTS) üzerinden verilen transit beyannamelerinde, "Kalemler" başlığı altında yer alan "Destekleyici Belgeler" alanına "BSS Kodu" türünün eklenebilmesi için gerekli teknik düzenlemeler yapılmıştır. Bu kapsamda, ihracatçı firmaların TPS ID numaralarını, Gümrükler Genel Müdürlüğü'nün NCTS programı üzerinden verilen transit beyannamelerinde beyan etmeleri; beyanname tescilinin ardından belgenin "Kapanmış" statüye geçmesinin sağlanması gerekmektedir. İhracat işlemlerine konu ürünler için düzenlenen BSS'lerin, ithalatçı ülke kontrol görevlileri tarafından sorgulandığı dikkate alındığında; ürünlerin giriş gümrüklerinde beklememesi ve mağduriyet yaşanmaması için, ihracatçı firmaların NCTS üzerinden verilen transit beyannamelerinde de TPS ID numaralarını beyan etmeleri gerekmektedir.