​Misyon : (Görev)

• İhraç edilen bitki ve bitkisel ürünlerin alıcı ülke zirai karantina şartlarına göre kontrollerini yapmak, hastalık ve zararlılardan arındırılmış olarak gönderilmesini sağlamak,
  
• İthal edilen bitki ve bitkisel ürünlerin ülkemiz zirai karantina şartlarına göre kontrollerini yaparak, dış karantinaya tabi organizmaların yurda girişine engel olmak,
  
• Transit geçen ve geçici süre ile gümrüklü sahalarda beklemesi gereken ürünlerin muayene ve kontrolünü yaparak geçişine-geçici girişine izin vermek,
  
• İthali – ihrac​​ı yasak olan bitki ve bitkisel ürünlerin yurda girişine ve çıkışına  engel olmak.