Misyonumuz :

• İhraç edilen bitki ve bitkisel ürünlerin alıcı ülke Zirai Karantina Şartlarına göre kontrollerini yapmak, hastalık ve zararlılardan arındırılmış olarak gönderilmesini sağlamak,
  
• İthal edilen bitki ve bitkisel ürünlerin Ülkemiz Zirai Karantina Şartlarına göre kontrollerini yaparak, Dış karantinaya tabi organizmaların yurda girişine engel olmak,
  
• Transit geçen ve geçici süre ile gümrüklü sahalarda beklemesi gereken ürünlerin muayene ve kontrolünü yaparak geçişine-geçici girişine izin vermek,
  
• İthali –ihraçı yasak olan bitki ve bitkisel ürünlerin yurda girişine ve çıkışına  engel olmak,
  
• İthal ve ihraç edilen bitkisel ürünlerin ve diğer maddelerin ambalaj malzemelerini, taşıma araçlarını, depolarını kontrol etmek ve gerektiğinde fümigasyon ve dezenfeksiyonunu yapmak veya yaptırmaktır.